Ngày 12/11/2013, Thủ tướng Chính phủ Nguyễn Tấn Dũng đã ký ban hành Nghị định số 162/2013/NĐ-CP quy định về xử phạt vi phạm hành chính trên các vùng biển, đảo và thềm lục địa của nước Cộng hòa xã hội chủ nghĩa Việt Nam. Nghị định quy định các mức xử phạt đối với các hành vi vi phạm các quy định về quản lý vùng biển, đảo và thềm lục địa của Việt Nam; vi phạm các quy định về hàng hải ngoài vùng nước cảng biển; vi phạm các quy định về bảo vệ môi trường biển. Các mức phạt khác quy định tại Nghị định này là mức phạt tiền đối với cá nhân. Mức phạt tiền đối với tổ chức bằng 2 lần mức phạt tiền đối với cá nhân. Ngoài ra, tổ chức, cá nhân vi phạm còn phải chịu các hình thức xử phạt bổ sung và phải thực hiện các biện pháp khắc phục hậu quả đã gây ra.
Về mức phạt tiền: Vi phạm các quy định về quản lý vùng biển, đảo và thềm lục địa của Việt Nam mức phạt đối với cá nhân là 1 tỷ đồng, tổ chức là 2 tỷ đồng. Vi phạm các quy định về quản lý vùng biển, đảo và thềm lục địa của nước Cộng hòa XHCN Việt Nam bị phạt đến 1 tỷ đồng. Cụ thể, phạt tiền 20 - 30 triệu đồng đối với hành vi dừng lại, neo đậu trái phép trong nội thủy, lãnh hải Việt Nam. Phạt tiền 80 - 100 triệu đồng đối với hành vi đi vào vùng cấm hoặc vùng hạn chế họat động trong lãnh hải Việt Nam. Phạt tiền 400 - 500 triệu đồng nếu tuyên truyền nhằm gây hại đến quốc phòng, an ninh của Việt Nam; phóng đi, tiếp nhận hay xếp phương tiện bay, phương tiện khác lên tàu thuyền. Phạt tiền 800 triệu đến 1 tỷ đồng nếu thu thập thông tin trái phép liên quan đến quốc phòng, an ninh của Việt Nam; luyện tập hay diễn tập trái phép dưới bất kỳ hình thức nào; xâm phạm vùng biển, đảo và thềm lục địa của nước Cộng hòa XHCN Việt Nam để điều tra, thăm dò và nghiên cứu khoa học tài nguyên biển Việt Nam; xâm phạm vùng biển, đảo, thềm lục địa nước Cộng hòa XHCN Việt Nam để hoạt động du lịch. Những tàu, thuyền Việt Nam không treo Quốc kỳ Việt Nam hoặc treo không đúng quy định bị phạt 2 - 4 triệu đồng. Tàu, thuyền nước ngoài không treo cờ quốc tịch, Quốc kỳ Việt Nam hoặc treo không đúng quy định khi hoạt động trong nội thủy Việt Nam bị phạt 5 - 10 triệu đồng. Các vi phạm quy định về hàng hải, ngoài vùng nước cảng biển bị phạt đến 100 triệu đồng. Cụ thể, tàu thuyền không có giấy phép rời cảng bị phạt 10 - 80 triệu đồng tùy vào tổng dung tích; phạt tiền 10 - 20 triệu đồng với hành vi thiếu một trong các loại tài liệu, giấy chứng nhận tàu thuyền đủ điều kiện hoạt động; phạt tiền 80 - 100 triệu đồng đối với hành vi tàu thuyền nước ngoài tham gia vận tải nội địa, thực hiện hoạt động đặc thù khi chưa có giấy phép hoặc văn bản chấp thuận của cơ quan có thẩm quyền Việt Nam. Với các vi phạm quy định về an toàn sinh mạng trên tàu biển: phạt đến 15 triệu đồng nếu các trang thiết bị cứu sinh không đảm bảo chất lượng; hết hạn sử dụng, bố trí không đúng quy định. Phạt 10 - 15 triệu đồng với hành vi chở hàng vượt trên từ 10% trở lên so với trọng tải cho phép. Tàu thuyền chở vượt quá 30 người so với số lượng cho phép sẽ bị phạt 60 - 80 triệu đồng. Phạt tiền 70 - 100 triệu đồng đối với hành vi không trục vớt tài sản chìm đắm gây nguy hiểm. Vi phạm các quy định về bảo vệ môi trường biển: Phạt tiền 250 - 500 triệu đồng với hành vi đổ các loại chất thải xuống vùng biển thuộc khu bảo tồn thiên nhiên, di sản tự nhiên, vùng có hệ sinh thái mới. Phạt từ 500 triệu đến 1 tỷ đồng với hành vi đổ chất thải nguy hại, chất thải có chứa chất phóng xạ xuống các vùng biển, đảo và thềm lục địa Việt Nam... Nghị định có hiệu lực thi hành kể từ 01/01/2014 và thay thế Nghị định số 137/2004/NĐ-CP, ngày 16/6/2004 của Chính phủ.